官能团的优先顺序：-COOH（羧基）>-SO3H（磺酸基）>-COOR（酯基）>-COX（卤基甲酰基）>-CONH2（氨基甲酰基）>-CN（氰基）>-CHO（醛基）>-CO-（羰基）>-OH（醇羟基）>-OH（酚羟基）>-SH（巯基）>-NH2（氨基）>-O-（醚基）>双键>叁键。
官能团是决定有机化合物的化学性质的原子或原子团。常见官能团烯烃、醇、酚、醚、醛、酮等。有机化学反应主要发生在官能团上，官能团对有机物的性质起决定作用，-X、-OH、-CHO、-COOH、-NO2、-SO3H、-NH2、RCO-，这些官能团就决定了有机物中的卤代烃、醇或酚、醛、羧酸、硝基化合物或亚硝酸酯、磺酸类有机物、胺类、酰胺类的化学性质。
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